Com a morte do Doutor António Agostinho Neto em 10 de Setembro de 1979 vítima de doença. José Eduardo dos Santos foi eleito Presidente e assume a direcção do MPLA.
Em 1980 orienta o 1º Congresso Extraordinário em 1985 o 2º Congresso Ordinário, com fundamentação política de Agostinho Neto. Em 1990 o MPLA realiza o 3º Congresso Ordinário, numa altura em que ocorriam transformações políticas, económicas e sociais em quase todo o mundo, que resultou sobretudo no desanuviamento da tenção internacional com o fim da guerra fria.
Em 1991 e 1992 realizou-se o 2º e 3º Congresso Extraordinários. Nessa altura verificou-se reformas na base jurídico-legal, com a consagração do multipartidarismo e da economia de mercado, neste período o MPLA voltou a transformar-se em partido de massas.
Em 1998, 2009 e 2013 o MPLA realiza o 4º 5º e 6º Congressos Ordinários, em 2011 realiza o 4º Congresso Extraordinário.
De 17 à 20 de Agosto o MPLA reúne o seu conclave para analisar e discutir a vida interna do partido, os desafios políticos, económicos e sociais de Angola. O VII Congresso Ordinário realiza-se sob o Lema, MPLA – Com o Povo Rumo a Vitória.
